MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Nasuia deltocephalinicola str. NAS-ALF

Total Repeats: 298

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021919	TTTTA	2	10	15	24	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021919	A	6	6	32	37	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021919	TTCAAA	2	12	44	55	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021919	A	7	7	68	74	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021919	TAA	2	6	80	85	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021919	TAA	3	9	91	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021919	A	9	9	98	106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021919	ATA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021919	A	6	6	125	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021919	TC	3	6	5224	5229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021919	GTAAA	2	10	5265	5274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021919	T	6	6	5286	5291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021919	TAA	2	6	5358	5363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021919	AT	3	6	5397	5402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021919	T	6	6	5402	5407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021919	TAA	2	6	6607	6612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021919	TCAAAA	2	12	6646	6657	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021919	T	6	6	6686	6691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021919	T	7	7	22997	23003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021919	A	6	6	23004	23009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021919	T	10	10	23014	23023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021919	A	7	7	23024	23030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021919	ATTAAA	2	12	23072	23083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021919	AATATT	2	12	23097	23108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021919	TAA	3	9	23122	23130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021919	AAT	2	6	27027	27032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021919	TTA	2	6	27034	27039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021919	TTAT	2	8	32366	32373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021919	T	6	6	32373	32378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021919	ATTT	2	8	32386	32393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021919	T	6	6	32391	32396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021919	TTATT	2	10	32403	32412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021919	TAT	2	6	32434	32439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021919	T	9	9	32443	32451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021919	ATT	2	6	32452	32457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021919	AATA	2	8	32458	32465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021919	AT	3	6	32469	32474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021919	GGT	2	6	33099	33104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021919	GGC	2	6	33105	33110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021919	TTAA	2	8	36560	36567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021919	T	6	6	36583	36588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021919	TAT	2	6	39403	39408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021919	TTA	2	6	39416	39421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021919	TTATAT	2	12	39428	39439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021919	ATTTT	2	10	39441	39450	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021919	TATT	2	8	39451	39458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021919	TTTA	2	8	39459	39466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021919	AATT	2	8	39478	39485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021919	T	7	7	39823	39829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021919	T	7	7	39832	39838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021919	ATT	2	6	39846	39851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021919	T	9	9	39860	39868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021919	AT	3	6	39870	39875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021919	ATT	3	9	42395	42403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021919	ATTTA	2	10	42406	42415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021919	TTTTA	2	10	42418	42427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021919	AT	6	12	42434	42445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021919	CAC	2	6	44815	44820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_021919	T	6	6	45392	45397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021919	ATCG	2	8	49113	49120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021919	TTTTA	2	10	50231	50240	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021919	T	6	6	50254	50259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021919	ATTCT	2	10	55552	55561	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021919	A	9	9	55918	55926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021919	TAAA	2	8	55927	55934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021919	TTAA	2	8	55947	55954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021919	ATTT	2	8	55969	55976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021919	AT	3	6	55977	55982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021919	ATT	2	6	55990	55995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021919	T	7	7	56007	56013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021919	T	6	6	56024	56029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021919	ATT	2	6	56042	56047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021919	T	7	7	56046	56052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021919	AT	3	6	59455	59460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021919	GA	3	6	59471	59476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021919	TAA	2	6	62135	62140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021919	TGGAT	2	10	62150	62159	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021919	TAA	2	6	64076	64081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021919	CAAAT	2	10	64123	64132	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_021919	TAAGC	2	10	64143	64152	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021919	A	6	6	72006	72011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021919	AT	3	6	72027	72032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021919	AAAT	2	8	72073	72080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021919	TAA	2	6	72091	72096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021919	AT	3	6	72105	72110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021919	A	9	9	72114	72122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021919	T	9	9	72123	72131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021919	AT	3	6	72135	72140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021919	TAAA	2	8	72142	72149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021919	TAT	2	6	72157	72162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021919	A	6	6	72173	72178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021919	A	9	9	72185	72193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021919	AATTTA	2	12	72198	72209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021919	TTA	2	6	72214	72219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021919	CTA	2	6	74191	74196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021919	CTA	2	6	74258	74263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021919	AT	3	6	75918	75923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021919	CTT	2	6	75978	75983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021919	TAAA	2	8	75984	75991	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021919	TTA	2	6	76013	76018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021919	GAA	2	6	76035	76040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021919	TCAAA	2	10	76068	76077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_021919	TCA	2	6	76102	76107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021919	TC	3	6	76179	76184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021919	A	8	8	76190	76197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021919	TAT	2	6	78043	78048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021919	GCT	2	6	78094	78099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021919	AT	3	6	79546	79551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021919	A	8	8	79553	79560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021919	AAAAT	2	10	79594	79603	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021919	A	6	6	79616	79621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021919	ATTA	2	8	79629	79636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021919	ATTAA	2	10	79659	79668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021919	AATAT	2	10	79669	79678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021919	A	6	6	79706	79711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021919	TA	3	6	79716	79721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021919	A	6	6	79761	79766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021919	T	6	6	79767	79772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021919	AAAT	2	8	89506	89513	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021919	ATTTT	2	10	89518	89527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021919	T	7	7	89604	89610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021919	TAA	2	6	89638	89643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021919	ATA	2	6	89646	89651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021919	TGT	2	6	89697	89702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021919	AAT	2	6	89712	89717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021919	A	9	9	89726	89734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021919	AT	3	6	89772	89777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021919	A	6	6	89835	89840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021919	AAT	2	6	89864	89869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021919	CTT	2	6	89873	89878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021919	TTAA	2	8	89894	89901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021919	GCT	2	6	89921	89926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021919	TC	3	6	89991	89996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021919	ACG	2	6	90038	90043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021919	GATGA	2	10	90114	90123	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021919	CCG	2	6	90146	90151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_021919	TG	3	6	90265	90270	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021919	TAGT	2	8	90273	90280	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021919	CTC	2	6	90351	90356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021919	AGG	2	6	90368	90373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021919	TTTAA	2	10	90412	90421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021919	GGT	2	6	90453	90458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021919	TAC	2	6	90514	90519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021919	A	6	6	90522	90527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021919	GTAG	2	8	90584	90591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021919	ATTTCA	2	12	90609	90620	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_021919	GCC	2	6	90723	90728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_021919	TTA	2	6	90836	90841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021919	ATT	2	6	90886	90891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021919	CTT	2	6	90912	90917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_021919	TTCC	2	8	90945	90952	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021919	CACC	2	8	90988	90995	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
153	NC_021919	ATT	2	6	91015	91020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021919	ATT	2	6	91058	91063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021919	TTTAA	2	10	91069	91078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021919	ATTT	2	8	91092	91099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_021919	T	7	7	91303	91309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021919	AT	3	6	91974	91979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_021919	ATT	2	6	92549	92554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_021919	ATA	2	6	111828	111833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_021919	A	7	7	111949	111955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_021919	TAAAT	2	10	111957	111966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_021919	A	7	7	112012	112018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_021919	A	7	7	112050	112056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_021919	TAAA	2	8	112076	112083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.